Целями функциональных центров станут исследования человека, как субъекта международных политических и экономических отношений, его созидательная деятельность, а также вопросы безопасности. В перечень функциональных центров включены:

  • Центр гуманитарных исследований,
  • Центр экономических исследований,
  • Центр военно-политических исследований.

Целью региональных исследований станет, соответственно, разноплановое изучение ситуации в регионах планеты, которые являются генераторами ключевых политических и экономических тенденций, и где сталкиваются интересы ведущих мировых держав. Создано шесть самостоятельных региональных центров:

  • Центр США, Канады и стран Латинской Америки,
  • Центр европейских исследований,
  • Центр Азии и АТР,
  • Центр Ближнего и Среднего Востока,
  • Центр Африки,
  • Центр исследований стран ближнего зарубежья.

В целях систематизации и координации исследовательской работы в РИСИ, а также формирования перспективных направлений исследовательской деятельности созданы:

  • Центр координации исследований,
  • Центр перспективных исследований.

Также в рамках РИСИ сформирован

  • Центр по связям с общественностью и СМИ.

В ходе реорганизации была проведена работа по формированию нового научного плана Института, выявлены ресурсы, позволяющие существенно повысить производительность труда и качество экспертной работы.

Изменение организационной структуры стало важным этапом преобразований в деятельности РИСИ и итогом первых 100 дней работы М.Е. Фрадкова на должности директора Института.

Комментируя проведенную реорганизацию, директор РИСИ М.Е. Фрадков отметил: «РИСИ – это экспертный центр Президента Российской Федерации. И мы должны оправдывать высокое доверие, которое нам оказано. От нас ждут не только более детальных и глубоких исследований актуальных проблем международных отношений, но также и повышения их практической значимости. Сегодня РИСИ находится в центре внимания специалистов-аналитиков, наших коллег, и мы готовы к сотрудничеству с ними. Но мы знаем и то, что РИСИ – на прицеле у организаторов информационных провокаций. Мы не оставляем это без внимания, делаем выводы и извлекаем уроки. Нам нужно быть профессиональнее, качественно делать свое дело и выдавать такую аналитическую продукцию, чтобы не было нужды опровергать домыслы, но гордиться своей эксклюзивной работой».